DMR 40135 chr12:485801-485950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr12:485801-485950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesKDM5A (0bp away)
ANODEV p-value0.00530280981805
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
40135 KDM5A 5886 uc001qif.1 chr12 389223 498620 - 150 100.0 1.41 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
40135 KDM5A 5886 uc010sdn.1 chr12 418969 498620 - 150 100.0 1.41 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
40135 KDM5A 5886 uc010sdo.1 chr12 432766 498620 - 150 100.0 0.68 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
40135 cellmeth_recounts PrEC: 2, LNCaP: 1, DU145: 4
40135 cellexp id=ENSG00000073614, name=KDM5A, PrEC=3930, str=4845, LNCaP=1904, str=2659, DU145=3197, str=2696
40135 tcgaexp gene=KDM5A, entrez=5927, pos=chr12:389223-498620(-), B=3797, L=3424, M=3514, H=3568
40135 tcgaexp gene=ZNF26, entrez=7574, pos=chr12:93510-133589154(+), B=419, L=392, M=412, H=512
40135 tcgaexp gene=ZNF84, entrez=7637, pos=chr12:42780-133639885(+), B=1626, L=1649, M=1716, H=2045