DMR 40558 chr14:74768501-74768650 (150bp)

DMR Stats
Positionchr14:74768501-74768650 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesABCD4 (0bp away)
ANODEV p-value0.0131745484575
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
40558 ABCD4 8448 uc001xpr.2 chr14 74751980 74769767 - 150 100.0 0.51 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
40558 ABCD4 8448 uc001xps.2 chr14 74751980 74769767 - 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
40558 ABCD4 8448 uc001xpu.2 chr14 74756994 74769767 - 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
40558 ABCD4 8448 uc001xpv.2 chr14 74758990 74769767 - 150 100.0 0.51 1 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
40558 ABCD4 8448 uc010tur.2 chr14 74753028 74769767 - 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
40558 chr14 74768479 74768510 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:2786251
40558 chr14 74767367 74769366 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:13208
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
40558 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 13, DU145: 14
40558 cellexp id=ENSG00000119688, name=ABCD4, PrEC=1461, str=2335, LNCaP=1997, str=1027, DU145=2052, str=1783
40558 tcgaexp gene=ABCD4, entrez=5826, pos=chr14:74751980-74769767(-), B=1336, L=1563, M=1478, H=1257