DMR 40915 chr16:936251-936450 (200bp)

DMR Stats
Positionchr16:936251-936450 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesLMF1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00156817543521
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 1.0 (16.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
40915 LMF1 10712 uc002ckk.2 chr16 903635 1031318 - 200 100.0 0.34 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
40915 LMF1 10712 uc010bri.2 chr16 903635 1020984 - 200 100.0 0.11 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
40915 LMF1 10712 uc010uuu.2 chr16 903635 1020984 - 200 100.0 0.38 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
40915 LMF1 10712 uc010uuv.1 chr16 931419 1020984 - 200 100.0 0.16 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0) 0.0
40915 LMF1 10712 uc021tad.1 chr16 903635 1020984 - 200 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
40915 LMF1 10712 uc021tae.1 chr16 903635 1020984 - 200 100.0 0.37 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
40915 chr16 936081 936555 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 16 score:1000, srow:427935
40915 chr16 935819 936448 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EZH2 score:257, expCount:1, expNums:40, expScores:257, srow:1445280
40915 chr16 936057 936372 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CTCF score:208, expCount:2, expNums:645,676, expScores:208,121, srow:1445281
40915 chr16 936074 936319 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RAD21 score:269, expCount:2, expNums:149,193, expScores:269,255, srow:1445282
40915 chr16 936091 936414 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SP1 score:172, expCount:1, expNums:153, expScores:172, srow:1445283
  • 5 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
40915 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 9, DU145: 4
40915 cellexp id=ENSG00000103227, name=LMF1, PrEC=235, str=1086, LNCaP=1115, str=1024, DU145=391, str=320
40915 tcgaexp gene=LMF1, entrez=64788, pos=chr16:903635-1031318(-), B=1235, L=1439, M=1400, H=1186