DMR 40917 chr16:951301-951450 (150bp)

DMR Stats
Positionchr16:951301-951450 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesLMF1 (0bp away)
ANODEV p-value0.00326529480676
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
40917 LMF1 10712 uc002ckk.2 chr16 903635 1031318 - 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
40917 LMF1 10712 uc010bri.2 chr16 903635 1020984 - 150 100.0 0.21 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
40917 LMF1 10712 uc010uuu.2 chr16 903635 1020984 - 150 100.0 24.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (100), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
40917 LMF1 10712 uc010uuv.1 chr16 931419 1020984 - 150 100.0 0.6 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
40917 LMF1 10712 uc021tad.1 chr16 903635 1020984 - 150 100.0 0.6 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
40917 LMF1 10712 uc021tae.1 chr16 903635 1020984 - 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
40917 chr16 951126 951475 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:341, srow:427960
40917 chr16 951314 951323 tfbsConsSites V$CREL_01 score:927, zScore:2.27, srow:1870681
40917 chr16 951314 951323 tfbsConsSites V$NFKAPPAB65_01 score:910, zScore:1.97, srow:1870682
40917 chr16 949961 951960 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:15589
  • 4 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
40917 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 3, DU145: 3
40917 cellexp id=ENSG00000103227, name=LMF1, PrEC=235, str=1086, LNCaP=1115, str=1024, DU145=391, str=320
40917 cellexp id=ENSG00000260316, name=LA16c-306A4.2, PrEC=0, str=2, LNCaP=3, str=4, DU145=3, str=0
40917 tcgaexp gene=LMF1, entrez=64788, pos=chr16:903635-1031318(-), B=1235, L=1439, M=1400, H=1186