DMR 41443 chr17:78846501-78846650 (150bp)

DMR Stats
Positionchr17:78846501-78846650 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRPTOR (0bp away)
ANODEV p-value0.0372821917974
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 1.0 (16.67%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
41443 RPTOR 13512 uc002jyt.1 chr17 78518625 78940173 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (100), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0) 0.0
41443 RPTOR 13512 uc010wug.1 chr17 78518625 78940173 + 150 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (100), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
  • 2 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
41443 chr17 78846346 78846855 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 12 score:342, srow:521800
41443 chr17 78846588 78846588 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:3873295
41443 chr17 78845402 78847401 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:17577
  • 3 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
41443 cellmeth_recounts PrEC: 5, LNCaP: 6, DU145: 0
41443 cellexp id=ENSG00000141564, name=RPTOR, PrEC=4002, str=2422, LNCaP=2854, str=2478, DU145=4689, str=4583
41443 tcgaexp gene=RPTOR, entrez=57521, pos=chr17:78518625-78940173(+), B=2895, L=2644, M=2412, H=2133