DMR 42416 chr22:42052351-42052500 (150bp)

DMR Stats
Positionchr22:42052351-42052500 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesXRCC6 (0bp away)
ANODEV p-value0.0374704353581
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
42416 XRCC6 19571 uc003bao.1 chr22 42017295 42060052 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42416 XRCC6 19571 uc003bap.1 chr22 42017295 42060052 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42416 XRCC6 19571 uc003bar.2 chr22 42017354 42060052 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
42416 XRCC6 19571 uc011apc.1 chr22 42017295 42060052 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (100), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
42416 cellmeth_recounts PrEC: 4, LNCaP: 1, DU145: 13
42416 cellexp id=ENSG00000196419, name=XRCC6, PrEC=25703, str=11517, LNCaP=16042, str=22301, DU145=24687, str=29901
42416 tcgaexp gene=XRCC6, entrez=2547, pos=chr22:42017295-42060052(+), B=17127, L=17534, M=17025, H=16749