DMR 42440 chr22:44485001-44485200 (200bp)

DMR Stats
Positionchr22:44485001-44485200 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPARVB (0bp away)
ANODEV p-value0.0105395534904
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
42440 PARVB 19628 uc003bem.3 chr22 44395091 44565112 + 200 100.0 0.74 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
42440 PARVB 19628 uc003ben.3 chr22 44420157 44565112 + 200 100.0 1.74 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42440 PARVB 19628 uc003beo.3 chr22 44464997 44565112 + 200 100.0 0.96 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42440 PARVB 19628 uc010gzn.3 chr22 44422184 44565112 + 200 100.0 2.19 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
42440 chr22 44485001 44485435 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 56 score:1000, srow:775379
42440 chr22 44485063 44485312 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOS score:186, expCount:1, expNums:558, expScores:186, srow:2704532
42440 chr22 44485124 44485399 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 STAT3 score:143, expCount:1, expNums:566, expScores:143, srow:2704533
  • 3 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
42440 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 3
42440 cellexp id=ENSG00000188677, name=PARVB, PrEC=1453, str=569, LNCaP=3270, str=2595, DU145=1616, str=1671
42440 tcgaexp gene=PARVB, entrez=29780, pos=chr22:44395091-44565112(+), B=901, L=1534, M=1288, H=1136