DMR 42443 chr22:45150201-45150350 (150bp)

DMR Stats
Positionchr22:45150201-45150350 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPRR5-ARHGAP8, ARHGAP8 (0bp away)
ANODEV p-value0.0140412115776
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 2.0 (33.33%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
42443 PRR5-ARHGAP8 19635 uc003bfd.3 chr22 45098078 45258664 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
42443 PRR5-ARHGAP8 19635 uc003bfg.1 chr22 45121124 45205681 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
42443 ARHGAP8 19635 uc003bfi.3 chr22 45148438 45246845 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
42443 ARHGAP8 19635 uc003bfj.3 chr22 45148438 45258664 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42443 ARHGAP8 19635 uc003bfk.3 chr22 45148438 45258664 + 150 100.0 0.48 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
42443 ARHGAP8 19635 uc010gzv.3 chr22 45148438 45258664 + 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
42443 PRR5-ARHGAP8 19635 uc011aqi.2 chr22 45098372 45258664 + 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
42443 PRR5-ARHGAP8 19635 uc011aqj.2 chr22 45121124 45258664 + 150 100.0 0.28 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
  • 8 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
42443 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 19, DU145: 28
42443 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=0, B=11, Length=200, Event=Up, log2FC=Inf, padj=0.00313959514768542
42443 cellexp id=ENSG00000241484, name=ARHGAP8, PrEC=203, str=251, LNCaP=95, str=74, DU145=58, str=64
42443 cellexp id=ENSG00000248405, name=PRR5-ARHGAP8, PrEC=5, str=30, LNCaP=25, str=12, DU145=8, str=15
42443 tcgaexp gene=ARHGAP8, entrez=23779, pos=chr22:45148438-45258664(+), B=851, L=1291, M=1164, H=1009
42443 tcgaexp gene=PRR5-ARHGAP8, entrez=553158, pos=chr22:45098078-45258664(+), B=70, L=72, M=82, H=93