DMR 42478 chr22:47390251-47390400 (150bp)

DMR Stats
Positionchr22:47390251-47390400 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesTBC1D22A (0bp away)
ANODEV p-value0.0148997120116
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 1.0 (16.67%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
42478 TBC1D22A 19676 uc003bib.3 chr22 47158518 47571342 + 150 100.0 0.33 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42478 TBC1D22A 19676 uc003bie.3 chr22 47158518 47571342 + 150 100.0 2.46 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
42478 TBC1D22A 19676 uc003bif.3 chr22 47169824 47571342 + 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42478 TBC1D22A 19676 uc010haf.3 chr22 47158518 47571342 + 150 100.0 0.41 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
42478 TBC1D22A 19676 uc010hag.3 chr22 47159639 47571342 + 150 100.0 0.33 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
42478 chr22 47390126 47390595 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 7 score:170, srow:778362
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
42478 cellmeth_recounts PrEC: 7, LNCaP: 4, DU145: 0
42478 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=12, B=0, Length=320, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=0.00174045876043459
42478 cellexp id=ENSG00000054611, name=TBC1D22A, PrEC=1931, str=1806, LNCaP=1361, str=1013, DU145=2013, str=1799
42478 tcgaexp gene=TBC1D22A, entrez=25771, pos=chr22:47158518-47571342(+), B=833, L=814, M=797, H=723