DMR 42480 chr22:47450351-47450550 (200bp)

DMR Stats
Positionchr22:47450351-47450550 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesTBC1D22A (0bp away)
ANODEV p-value0.0039406309438
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 1.0 (16.67%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
42480 TBC1D22A 19676 uc003bib.3 chr22 47158518 47571342 + 200 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42480 TBC1D22A 19676 uc003bie.3 chr22 47158518 47571342 + 200 100.0 3.93 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
42480 TBC1D22A 19676 uc003bif.3 chr22 47169824 47571342 + 200 100.0 3.93 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
42480 TBC1D22A 19676 uc010haf.3 chr22 47158518 47571342 + 200 100.0 0.28 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
42480 TBC1D22A 19676 uc010hag.3 chr22 47159639 47571342 + 200 100.0 0.23 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
42480 chr22 47450386 47450615 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 2 score:356, srow:778458
42480 chr22 47450471 47450488 tfbsConsSites V$CART1_01 score:816, zScore:2.31, srow:3264131
42480 chr22 47450505 47450507 phastConsElements100way lod=15 score:262, srow:5643303
42480 chr22 47450512 47450516 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:5643304
42480 chr22 47450550 47450570 phastConsElements100way lod=24 score:308, srow:5643305
  • 5 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
42480 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 3, DU145: 0
42480 cellexp id=ENSG00000054611, name=TBC1D22A, PrEC=1931, str=1806, LNCaP=1361, str=1013, DU145=2013, str=1799
42480 tcgaexp gene=TBC1D22A, entrez=25771, pos=chr22:47158518-47571342(+), B=833, L=814, M=797, H=723