DMR 444 chr1:144921451-144921650 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:144921451-144921650 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesLOC653513, PDE4DIP, NBPF9, LOC100288142 (0bp away)
ANODEV p-value0.0407939394992
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
444 LOC653513 1475 uc001elk.2 chr1 144676437 144995033 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
444 LOC653513 1475 uc001ell.2 chr1 144676437 144995082 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
444 LOC653513 1475 uc001elm.4 chr1 144676437 145039992 - 200 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
444 LOC653513 1475 uc001eln.4 chr1 144676437 145039992 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc001elo.3 chr1 144676437 145076186 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc001elw.4 chr1 144851424 144995033 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc001elx.4 chr1 144851424 145039992 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc001emb.1 chr1 144890591 144932032 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc001emc.2 chr1 144890591 144995033 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc001emd.2 chr1 144890591 144995033 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc001eme.1 chr1 144895122 144922047 - 200 100.0 0.04 0 51.5 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
444 NBPF9 1460 uc010oye.3 chr1 144594404 145370304 + 200 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (100), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
444 LOC100288142 1460 uc021ots.1 chr1 144184252 145339512 + 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (100), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
444 LOC100288142 1460 uc021ott.2 chr1 144146811 146467744 + 200 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (100), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (0), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0), I74 (0), E75 (0), I75 (0), E76 (0), I76 (0), E77 (0), I77 (0), E78 (0), I78 (0), E79 (0), I79 (0), E80 (0), I80 (0), E81 (0), I81 (0), E82 (0), I82 (0), E83 (0), I83 (0), E84 (0), I84 (0), E85 (0), I85 (0), E86 (0), I86 (0), E87 (0), I87 (0), E88 (0), I88 (0), E89 (0), I89 (0), E90 (0), I90 (0), E91 (0), I91 (0), E92 (0), I92 (0), E93 (0), I93 (0), E94 (0), I94 (0), E95 (0), I95 (0), E96 (0), I96 (0), E97 (0), I97 (0), E98 (0), I98 (0), E99 (0), I99 (0), E100 (0), I100 (0), E101 (0), I101 (0), E102 (0), I102 (0), E103 (0), I103 (0), E104 (0), I104 (0), E105 (0), I105 (0), E106 (0), I106 (0), E107 (0), I107 (0), E108 (0), I108 (0), E109 (0), I109 (0), E110 (0), I110 (0), E111 (0), I111 (0), E112 (0), I112 (0), E113 (0), I113 (0), E114 (0), I114 (0), E115 (0), I115 (0), E116 (0), I116 (0), E117 (0), I117 (0), E118 (0), I118 (0), E119 (0), I119 (0), E120 (0), I120 (0), E121 (0), I121 (0), E122 (0), I122 (0), E123 (0), I123 (0), E124 (0), I124 (0), E125 (0), I125 (0), E126 (0), I126 (0), E127 (0), I127 (0), E128 (0), I128 (0), E129 (0), I129 (0), E130 (0), I130 (0), E131 (0), I131 (0), E132 (0) 0.0
444 PDE4DIP 1475 uc021ouh.1 chr1 144851424 144995033 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (100), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0) 0.0
444 NBPF9 1460 uc031pnx.1 chr1 144614840 145370304 + 200 100.0 0.04 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
  • 16 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
444 chr1 144921621 144921970 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 9 score:1000, srow:67760
444 chr1 144921503 144922046 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NFIC score:408, expCount:1, expNums:187, expScores:408, srow:236078
444 chr1 144921534 144921973 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TEAD4 score:313, expCount:1, expNums:201, expScores:313, srow:236079
444 chr1 144921577 144921876 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RXRA score:234, expCount:1, expNums:194, expScores:234, srow:236080
444 chr1 144921581 144921876 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 HNF4A score:598, expCount:2, expNums:182,432, expScores:598,265, srow:236081
444 chr1 144921596 144921935 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 HDAC2 score:282, expCount:1, expNums:181, expScores:282, srow:236082
444 chr1 144921596 144921885 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOXA2 score:462, expCount:1, expNums:179, expScores:462, srow:236083
444 chr1 144921600 144921922 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NR3C1 score:280, expCount:2, expNums:56,58, expScores:280,164, srow:236084
444 chr1 144921603 144921886 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOXA1 score:665, expCount:2, expNums:177,178, expScores:433,665, srow:236085
444 chr1 144921610 144921893 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 HSF1 score:239, expCount:1, expNums:433, expScores:239, srow:236086
444 chr1 144921617 144921895 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 JUND score:173, expCount:2, expNums:184,435, expScores:156,173, srow:236087
444 chr1 144921625 144922004 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ARID3A score:331, expCount:1, expNums:422, expScores:331, srow:236088
444 chr1 144921644 144921903 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOSL2 score:171, expCount:1, expNums:176, expScores:171, srow:236089
444 chr1 144921645 144921920 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAFF score:463, expCount:1, expNums:436, expScores:463, srow:236090
444 chr1 144921649 144921852 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 CEBPB score:773, expCount:3, expNums:172,425,426, expScores:304,683,773, srow:236091
444 chr1 144921650 144922039 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RAD21 score:255, expCount:2, expNums:193,448, expScores:255,156, srow:236092
  • 16 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
444 cellmeth_recounts PrEC: 11, LNCaP: 9, DU145: 36
444 cellexp id=ENSG00000178104, name=PDE4DIP, PrEC=6854, str=9204, LNCaP=1923, str=1533, DU145=5728, str=5361
444 tcgaexp gene=PDE4DIP, entrez=9659, pos=chr1:144676437-145076186(-), B=4154, L=2441, M=3224, H=3629
444 tcgaexp gene=NBPF9, entrez=400818, pos=chr1:144146811-148346929(-), B=433, L=627, M=621, H=693
444 tcgaexp gene=PPIAL4B, entrez=653505, pos=chr1:144363462-149553787(-), B=0, L=0, M=0, H=0
444 tcgaexp gene=LINC00623, entrez=728855, pos=chr1:144300512-149616786(-), B=727, L=966, M=1062, H=1250
444 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305