DMR 4702 chr8:141810501-141810650 (150bp)

DMR Stats
Positionchr8:141810501-141810650 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesPTK2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00196460309893
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
4702 PTK2 28979 uc003yvp.3 chr8 141668481 141810675 - 150 100.0 3.66 0 100.0 E1 (62), I1 (38), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc003yvq.3 chr8 141668481 141856421 - 150 100.0 0.33 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (62), I6 (38), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc003yvr.3 chr8 141668481 141889736 - 150 100.0 0.66 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (62), I9 (38), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc003yvs.3 chr8 141668481 141900868 - 150 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (62), I10 (38), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc003yvt.3 chr8 141668481 142011412 - 150 100.0 0.49 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (62), I12 (38), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc003yvu.3 chr8 141668481 142011412 - 150 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (62), I12 (38), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc003yvv.3 chr8 141668481 142011412 - 150 100.0 0.33 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (62), I10 (38), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc011ljq.2 chr8 141668481 141810675 - 150 100.0 0.49 0 100.0 E1 (62), I1 (38), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
4702 PTK2 28979 uc011ljr.2 chr8 141668481 142011412 - 150 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (62), I12 (38), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0) 0.0
  • 9 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
4702 chr8 141810621 141810830 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 4 score:159, srow:1193797
4702 chr8 141810624 141810643 tfbsConsSites V$YY1_02 score:813, zScore:2.51, srow:5272774
4702 chr8 141810630 141810644 tfbsConsSites V$E2F_01 score:758, zScore:1.68, srow:5272775
4702 chr8 141810556 141810556 cosmic COSM1222484 srow:1173024
4702 chr8 141810556 141810556 cosmic COSM1222485 srow:1173025
4702 chr8 141810556 141810556 cosmic COSM1222483 srow:1173026
4702 chr8 141810586 141810586 cosmic COSM1455167 srow:1173027
4702 chr8 141810586 141810586 cosmic COSM1455168 srow:1173028
4702 chr8 141810586 141810586 cosmic COSM1455166 srow:1173029
4702 chr8 141810641 141810641 cosmic COSM749889 srow:1173030
4702 chr8 141810641 141810641 cosmic COSM749890 srow:1173031
4702 chr8 141810641 141810641 cosmic COSM749888 srow:1173032
4702 chr8 141810553 141810564 phastConsElements100way lod=143 score:485, srow:9090271
4702 chr8 141810566 141810579 phastConsElements100way lod=140 score:483, srow:9090272
4702 chr8 141810581 141810585 phastConsElements100way lod=57 score:394, srow:9090273
4702 chr8 141810587 141810594 phastConsElements100way lod=28 score:323, srow:9090274
4702 chr8 141810596 141810603 phastConsElements100way lod=77 score:423, srow:9090275
4702 chr8 141810605 141810612 phastConsElements100way lod=103 score:452, srow:9090276
4702 chr8 141810614 141810615 phastConsElements100way lod=27 score:320, srow:9090277
4702 chr8 141810617 141810639 phastConsElements100way lod=233 score:533, srow:9090278
4702 chr8 141810641 141810642 phastConsElements100way lod=34 score:343, srow:9090279
4702 chr8 141810644 141810648 phastConsElements100way lod=70 score:414, srow:9090280
4702 chr8 141810650 141810654 phastConsElements100way lod=56 score:392, srow:9090281
  • 23 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
4702 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 1, DU145: 3
4702 cellexp id=ENSG00000169398, name=PTK2, PrEC=11138, str=11556, LNCaP=5025, str=5682, DU145=8308, str=8621
4702 tcgaexp gene=PTK2, entrez=5747, pos=chr8:141668481-142011412(-), B=5821, L=5226, M=5532, H=7040