DMR 47632 chr1:186158851-186159000 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:186158851-186159000 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesHMCN1, MIR548F1 (0bp away)
ANODEV p-value0.000135485973438
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 4.0 (66.67%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
47632 HMCN1 2295 uc001grq.1 chr1 185703683 186160085 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (0), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0), I74 (0), E75 (0), I75 (0), E76 (0), I76 (0), E77 (0), I77 (0), E78 (0), I78 (0), E79 (0), I79 (0), E80 (0), I80 (0), E81 (0), I81 (0), E82 (0), I82 (0), E83 (0), I83 (0), E84 (0), I84 (0), E85 (0), I85 (0), E86 (0), I86 (0), E87 (0), I87 (0), E88 (0), I88 (0), E89 (0), I89 (0), E90 (0), I90 (0), E91 (0), I91 (0), E92 (0), I92 (0), E93 (0), I93 (0), E94 (0), I94 (0), E95 (0), I95 (0), E96 (0), I96 (0), E97 (0), I97 (0), E98 (0), I98 (0), E99 (0), I99 (0), E100 (0), I100 (0), E101 (0), I101 (0), E102 (0), I102 (0), E103 (0), I103 (0), E104 (0), I104 (0), E105 (0), I105 (0), E106 (0), I106 (0), E107 (100) 0.0
47632 HMCN1 2295 uc001grs.1 chr1 186097210 186160085 + 150 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (100) 0.0
47632 MIR548F1 2296 uc021pgf.1 chr1 186029867 186446655 - 150 100.0 80.74 1 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
47632 chr1 186158888 186158894 tfbsConsSites V$EN1_01 score:1000, zScore:2.33, srow:389964
47632 chr1 186158973 186158983 tfbsConsSites V$POU6F1_01 score:852, zScore:1.91, srow:389965
47632 chr1 186158974 186158985 tfbsConsSites V$HFH1_01 score:926, zScore:2.79, srow:389966
47632 chr1 186158994 186159007 tfbsConsSites V$GATA1_02 score:844, zScore:1.89, srow:389967
47632 chr1 186158861 186158861 cosmic COSM244928 srow:94601
47632 chr1 186158885 186158885 cosmic COSM208956 srow:94602
47632 chr1 186158886 186158886 cosmic COSM1337177 srow:94603
47632 chr1 186158894 186158894 cosmic COSM208957 srow:94604
47632 chr1 186158912 186158912 cosmic COSM1668291 srow:94605
47632 chr1 186158913 186158913 cosmic COSM208958 srow:94606
47632 chr1 186158948 186158948 cosmic COSM244927 srow:94607
47632 chr1 186158963 186158963 cosmic COSM531157 srow:94608
47632 chr1 186158994 186158994 cosmic COSM244929 srow:94609
47632 chr1 186158835 186158868 phastConsElements100way lod=312 score:562, srow:673180
47632 chr1 186158870 186158871 phastConsElements100way lod=35 score:345, srow:673181
47632 chr1 186158873 186158880 phastConsElements100way lod=83 score:431, srow:673182
47632 chr1 186158882 186158886 phastConsElements100way lod=28 score:323, srow:673183
47632 chr1 186158888 186158889 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:673184
47632 chr1 186158891 186158892 phastConsElements100way lod=27 score:320, srow:673185
47632 chr1 186158894 186158901 phastConsElements100way lod=62 score:402, srow:673186
47632 chr1 186158903 186158907 phastConsElements100way lod=58 score:395, srow:673187
47632 chr1 186158909 186158922 phastConsElements100way lod=166 score:500, srow:673188
47632 chr1 186158924 186158928 phastConsElements100way lod=49 score:379, srow:673189
47632 chr1 186158930 186158940 phastConsElements100way lod=84 score:432, srow:673190
47632 chr1 186158945 186158946 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:673191
  • Page 1 of 2
  • 25 of 31 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
47632 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 0
47632 cellexp id=ENSG00000143341, name=HMCN1, PrEC=483, str=594, LNCaP=1, str=2, DU145=8, str=11
47632 tcgaexp gene=HMCN1, entrez=83872, pos=chr1:185703683-186160085(+), B=1329, L=1096, M=1204, H=1518