DMR 51151 chr16:2607851-2608000 (150bp)

DMR Stats
Positionchr16:2607851-2608000 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextexon
Nearest GenesPDPK1 (0bp away)
ANODEV p-value0.000129646347467
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 4.0 (66.67%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
51151 PDPK1 10797 uc002cqs.4 chr16 2587965 2653191 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (76), I2 (24.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
51151 PDPK1 10797 uc002cqt.4 chr16 2587965 2653191 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (76), I2 (24.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
51151 PDPK1 10797 uc002cqu.4 chr16 2588165 2653191 + 150 100.0 0.5 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (76), I2 (24.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
51151 PDPK1 10797 uc002cqv.1 chr16 2606897 2634065 + 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (76), I1 (24.67), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
51151 PDPK1 10797 uc010bsn.4 chr16 2587965 2653191 + 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (76), I2 (24.67), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
51151 PDPK1 10797 uc010uwe.2 chr16 2587965 2612228 + 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (76), I2 (24.67), E3 (0) 0.0
  • 6 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
51151 chr16 2607928 2607940 tfbsConsSites V$IK1_01 score:864, zScore:1.96, srow:1876523
51151 chr16 2607929 2607937 tfbsConsSites V$LYF1_01 score:940, zScore:1.75, srow:1876524
51151 chr16 2607948 2607963 tfbsConsSites V$MEF2_01 score:772, zScore:2.02, srow:1876525
51151 chr16 2607879 2607879 cosmic COSM1376969 srow:423544
51151 chr16 2607959 2607959 cosmic COSM1376970 srow:423545
51151 chr16 2607961 2607961 cosmic COSM13350 srow:423546
51151 chr16 2607854 2607858 phastConsElements100way lod=22 score:300, srow:3229570
51151 chr16 2607864 2607866 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:3229571
51151 chr16 2607875 2607879 phastConsElements100way lod=30 score:330, srow:3229572
51151 chr16 2607884 2607888 phastConsElements100way lod=40 score:359, srow:3229573
51151 chr16 2607896 2607915 phastConsElements100way lod=228 score:531, srow:3229574
51151 chr16 2607917 2607939 phastConsElements100way lod=279 score:551, srow:3229575
51151 chr16 2607941 2607945 phastConsElements100way lod=67 score:410, srow:3229576
51151 chr16 2607947 2607960 phastConsElements100way lod=190 score:513, srow:3229577
51151 chr16 2607962 2607971 phastConsElements100way lod=121 score:468, srow:3229578
  • 15 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
51151 cellmeth_recounts PrEC: 15, LNCaP: 1, DU145: 0
51151 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=22, B=1, Length=380, Event=Down, log2FC=-4.46, padj=5.80135062334059e-05
51151 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=22, B=0, Length=380, Event=Down, log2FC=-Inf, padj=2.6934033431747e-06
51151 cellexp id=ENSG00000140992, name=PDPK1, PrEC=2477, str=2989, LNCaP=2995, str=3021, DU145=1472, str=1950
51151 tcgaexp gene=PDPK1, entrez=5170, pos=chr16:2587965-2653191(+), B=3709, L=4084, M=4243, H=4451