DMR 52035 chr20:9703101-9703300 (200bp)

DMR Stats
Positionchr20:9703101-9703300 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesPAK7 (0bp away)
ANODEV p-value0.000991362045771
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 5.0 (83.33%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
52035 PAK7 17995 uc002wnj.2 chr20 9518037 9819687 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
52035 PAK7 17995 uc002wnk.2 chr20 9518037 9819687 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
52035 PAK7 17995 uc002wnl.2 chr20 9518037 9819687 - 200 100.0 0.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
52035 PAK7 17995 uc010gby.1 chr20 9518037 9819687 - 200 100.0 0.02 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
52035 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 0, DU145: 3
52035 cellexp id=ENSG00000101349, name=PAK7, PrEC=6, str=27, LNCaP=3, str=6, DU145=0, str=0
52035 tcgaexp gene=PAK7, entrez=57144, pos=chr20:9518037-9819687(-), B=106, L=35, M=35, H=21