DMR 52162 chr21:15539301-15539450 (150bp)

DMR Stats
Positionchr21:15539301-15539450 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesLIPI (0bp away)
ANODEV p-value0.00184850216609
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 5.0 (83.33%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
52162 LIPI 18652 uc002yjm.3 chr21 15481135 15579254 - 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
52162 LIPI 18652 uc010gkw.2 chr21 15481135 15583212 - 150 100.0 9.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
52162 LIPI 18652 uc021whe.1 chr21 15481135 15583212 - 150 100.0 0.66 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
52162 LIPI 18652 uc021whf.1 chr21 15481135 15583212 - 150 100.0 0.66 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
52162 LIPI 18652 uc021whg.1 chr21 15481135 15583212 - 150 100.0 0.65 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
52162 LIPI 18652 uc021whh.1 chr21 15481135 15583212 - 150 100.0 0.65 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0) 0.0
52162 LIPI 18652 uc021whi.1 chr21 15481135 15583212 - 150 100.0 0.3 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
52162 LIPI 18652 uc021whj.1 chr21 15481135 15583212 - 150 100.0 0.51 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
  • 8 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
52162 chr21 15539038 15539347 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MYC score:351, expCount:2, expNums:560,624, expScores:351,248, srow:2575979
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
52162 cellmeth_recounts PrEC: 2, LNCaP: 0, DU145: 0
52162 cellexp id=ENSG00000188992, name=LIPI, PrEC=0, str=0, LNCaP=1, str=0, DU145=4, str=5
52162 tcgaexp gene=LIPI, entrez=149998, pos=chr21:15481135-15583212(-), B=1, L=0, M=0, H=1