DMR 52168 chr21:19746701-19746850 (150bp)

DMR Stats
Positionchr21:19746701-19746850 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesTMPRSS15 (0bp away)
ANODEV p-value0.0028048105697
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 6.0 (100.0%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
52168 TMPRSS15 18676 uc002ykw.3 chr21 19641433 19775970 - 150 100.0 48.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0) 0.0
  • 1 genes

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
52168 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 10
52168 cellexp id=ENSG00000154646, name=TMPRSS15, PrEC=1, str=4, LNCaP=1, str=1, DU145=0, str=0
52168 tcgaexp gene=TMPRSS15, entrez=5651, pos=chr21:19641433-19775970(-), B=2, L=1, M=1, H=2