DMR 526 chr1:179068751-179068900 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:179068751-179068900 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesABL2 (0bp away)
ANODEV p-value0.0232163548303
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
526 ABL2 2212 uc001gmg.4 chr1 179068462 179112224 - 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (100) 100.0
526 ABL2 2212 uc001gmi.4 chr1 179068462 179112224 - 150 100.0 0.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 100.0
526 ABL2 2212 uc001gmj.4 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 100.0
526 ABL2 2212 uc010pne.2 chr1 179068462 179112224 - 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 100.0
526 ABL2 2212 uc010pnf.2 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 1.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (100) 100.0
526 ABL2 2212 uc010png.2 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 1.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 100.0
526 ABL2 2212 uc010pnh.2 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 0.6 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (100) 100.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
526 chr1 179068721 179068955 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 6 score:185, srow:84865
526 chr1 179068739 179068762 tfbsConsSites V$COMP1_01 score:788, zScore:1.75, srow:373518
526 chr1 179068744 179068757 tfbsConsSites V$CEBP_Q2 score:889, zScore:1.86, srow:373519
526 chr1 179068753 179068771 tfbsConsSites V$GR_Q6 score:829, zScore:1.79, srow:373520
526 chr1 179068844 179068853 tfbsConsSites V$TATA_C score:894, zScore:1.83, srow:373521
526 chr1 179068759 179068763 phastConsElements100way lod=19 score:285, srow:643374
526 chr1 179068787 179068796 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:643375
526 chr1 179068808 179068815 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:643376
526 chr1 179068819 179068833 phastConsElements100way lod=125 score:471, srow:643377
526 chr1 179068836 179068837 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:643378
526 chr1 179068867 179068888 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:643379
  • 11 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
526 cellmeth_recounts PrEC: 10, LNCaP: 1, DU145: 3
526 cellexp id=ENSG00000143322, name=ABL2, PrEC=5055, str=11904, LNCaP=1282, str=1641, DU145=11778, str=16871
526 tcgaexp gene=ABL2, entrez=27, pos=chr1:179068462-179198819(-), B=1501, L=1642, M=1768, H=1925
526 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305