DMR 527 chr1:179079101-179079250 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:179079101-179079250 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesABL2 (0bp away)
ANODEV p-value0.00804411883644
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
527 ABL2 2212 uc001gmg.4 chr1 179068462 179112224 - 150 100.0 0.6 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
527 ABL2 2212 uc001gmi.4 chr1 179068462 179112224 - 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0) 0.0
527 ABL2 2212 uc001gmj.4 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0) 0.0
527 ABL2 2212 uc010pne.2 chr1 179068462 179112224 - 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
527 ABL2 2212 uc010pnf.2 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (100), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
527 ABL2 2212 uc010png.2 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
527 ABL2 2212 uc010pnh.2 chr1 179068462 179198819 - 150 100.0 0.1 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (100), E11 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
527 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 3, DU145: 1
527 cellexp id=ENSG00000143322, name=ABL2, PrEC=5055, str=11904, LNCaP=1282, str=1641, DU145=11778, str=16871
527 tcgaexp gene=ABL2, entrez=27, pos=chr1:179068462-179198819(-), B=1501, L=1642, M=1768, H=1925
527 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305