DMR 572 chr1:203696401-203696600 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:203696401-203696600 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesATP2B4 (0bp away)
ANODEV p-value0.0062855380097
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
572 ATP2B4 2410 uc001gzv.3 chr1 203595915 203713209 + 200 100.0 0.44 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (61), E20 (39), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
572 ATP2B4 2410 uc001gzw.3 chr1 203595915 203713209 + 200 100.0 0.44 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (61), E20 (39), I20 (0), E21 (0) 0.0
572 ATP2B4 2410 uc001gzx.3 chr1 203691606 203713209 + 200 100.0 0.73 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (61), E3 (39), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
572 ATP2B4 2410 uc009xaq.3 chr1 203651870 203702757 + 200 100.0 0.58 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (61), E19 (39), I19 (0), E20 (0) 0.0
572 ATP2B4 2410 uc009xar.3 chr1 203691606 203713209 + 200 100.0 0.44 0 0.0 E1 (0), I1 (61), E2 (39), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
572 chr1 203696528 203696541 tfbsConsSites V$MRF2_01 score:831, zScore:1.74, srow:421082
572 chr1 203696525 203696525 cosmic COSM1668389 srow:101882
572 chr1 203696525 203696525 cosmic COSM1668388 srow:101883
572 chr1 203696535 203696535 cosmic COSM678045 srow:101884
572 chr1 203696535 203696535 cosmic COSM678044 srow:101885
572 chr1 203696564 203696564 cosmic COSM272371 srow:101886
572 chr1 203696564 203696564 cosmic COSM272370 srow:101887
572 chr1 203696520 203696522 phastConsElements100way lod=45 score:370, srow:721170
572 chr1 203696524 203696524 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:721171
572 chr1 203696526 203696530 phastConsElements100way lod=42 score:363, srow:721172
572 chr1 203696535 203696536 phastConsElements100way lod=22 score:300, srow:721173
572 chr1 203696538 203696539 phastConsElements100way lod=30 score:330, srow:721174
572 chr1 203696541 203696542 phastConsElements100way lod=25 score:312, srow:721175
572 chr1 203696547 203696569 phastConsElements100way lod=215 score:525, srow:721176
572 chr1 203696571 203696572 phastConsElements100way lod=46 score:373, srow:721177
572 chr1 203696574 203696575 phastConsElements100way lod=29 score:327, srow:721178
572 chr1 203696577 203696578 phastConsElements100way lod=40 score:359, srow:721179
572 chr1 203696586 203696596 phastConsElements100way lod=129 score:475, srow:721180
  • 18 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
572 cellmeth_recounts PrEC: 13, LNCaP: 6, DU145: 1
572 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=20, B=2, Length=200, Event=Down, log2FC=-3.32, padj=0.0013002809333493
572 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=20, B=1, Length=340, Event=Down, log2FC=-4.32, padj=0.000246010682141716
572 cellexp id=ENSG00000058668, name=ATP2B4, PrEC=14444, str=22886, LNCaP=3939, str=6036, DU145=15678, str=17768
572 tcgaexp gene=ATP2B4, entrez=493, pos=chr1:203595915-203713209(+), B=13713, L=6352, M=6156, H=5311