DMR 6044 chr11:93105051-93105200 (150bp)

DMR Stats
Positionchr11:93105051-93105200 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCCDC67 (0bp away)
ANODEV p-value1.35471657604e-05
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
6044 CCDC67 5459 uc001pdo.1 chr11 93063156 93148366 + 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
6044 CCDC67 5459 uc001pdp.3 chr11 93063167 93129533 + 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
6044 CCDC67 5459 uc001pdq.3 chr11 93063883 93171636 + 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
6044 cellmeth_recounts PrEC: 1, LNCaP: 0, DU145: 13
6044 cellexp id=ENSG00000165325, name=CCDC67, PrEC=2, str=0, LNCaP=59, str=101, DU145=45, str=43
6044 tcgaexp gene=CCDC67, entrez=159989, pos=chr11:93063156-93171636(+), B=54, L=53, M=57, H=73