DMR 6769 chr13:46603501-46603700 (200bp)

DMR Stats
Positionchr13:46603501-46603700 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesZC3H13 (0bp away)
ANODEV p-value0.00148087590268
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 0.0 (0.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
6769 ZC3H13 7514 uc001vas.1 chr13 46536314 46626894 - 200 100.0 0.52 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
6769 ZC3H13 7514 uc001vat.1 chr13 46542883 46626881 - 200 100.0 0.52 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
6769 ZC3H13 7514 uc010tfw.1 chr13 46529805 46619648 - 200 100.0 1.48 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
6769 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 1, DU145: 17
6769 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=0, B=13, Length=360, Event=Up, log2FC=Inf, padj=0.000941091010072773
6769 cellexp id=ENSG00000123200, name=ZC3H13, PrEC=7782, str=6027, LNCaP=3688, str=4469, DU145=5697, str=6209
6769 tcgaexp gene=ZC3H13, entrez=23091, pos=chr13:46529805-46626894(-), B=5343, L=4328, M=4188, H=3989