DMR 7601 chr16:184601-184800 (200bp)

DMR Stats
Positionchr16:184601-184800 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesNPRL3 (0bp away)
ANODEV p-value0.000803949678197
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 1.0 (11.11 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
7601 NPRL3 10657 uc002cfp.2 chr16 134273 188697 - 200 100.0 0.05 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
7601 NPRL3 10657 uc002cfq.3 chr16 135804 188697 - 200 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0) 0.0
7601 NPRL3 10657 uc002cfr.3 chr16 135804 188697 - 200 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) 0.0
7601 NPRL3 10657 uc010uua.1 chr16 134273 188333 - 200 100.0 0.08 1 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
7601 NPRL3 10657 uc021szl.1 chr16 135804 188697 - 200 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0) 0.0
7601 NPRL3 10657 uc021szm.1 chr16 135804 188697 - 200 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) 0.0
7601 NPRL3 10657 uc021szn.1 chr16 135804 188697 - 200 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
7601 chr16 184406 184675 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 3 score:420, srow:427204
7601 chr16 184615 186614 cpgShelf — values(x.gr)[overs$srow, ]:13399
  • 2 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
7601 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 0, DU145: 12
7601 cellexp id=ENSG00000103148, name=NPRL3, PrEC=4044, str=1619, LNCaP=6038, str=4481, DU145=2617, str=1896
7601 tcgaexp gene=NPRL3, entrez=8131, pos=chr16:134273-188697(-), B=1843, L=2423, M=2521, H=2379