DMR 761 chr2:3665251-3665500 (250bp)

DMR Stats
Positionchr2:3665251-3665500 (View on UCSC)
Width250bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesCOLEC11, BC113076 (0bp away)
ANODEV p-value0.00537519396005
FrequenciesBenign: 7.0 (100.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
761 COLEC11 15980 uc002qxz.4 chr2 3642422 3692234 + 250 100.0 0.51 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc002qya.4 chr2 3642422 3692234 + 250 100.0 5.2 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc002qyb.4 chr2 3642422 3692234 + 250 100.0 9.68 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc002qyc.4 chr2 3642422 3692234 + 250 100.0 0.83 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
761 BC113076 15981 uc002qyd.1 chr2 3664890 3665294 - 44 17.6 0.83 1 100.0 E1 (17.6) 100.0
761 COLEC11 15980 uc010ewo.4 chr2 3642422 3692234 + 250 100.0 0.94 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc010ewp.4 chr2 3653642 3692234 + 250 100.0 0.71 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc010ewq.4 chr2 3653642 3692234 + 250 100.0 0.71 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc010ewr.4 chr2 3653642 3692234 + 250 100.0 0.37 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc010ews.4 chr2 3653642 3692234 + 250 100.0 0.28 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc031rnm.1 chr2 3642422 3692234 + 250 100.0 0.28 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
761 COLEC11 15980 uc031rnn.1 chr2 3649496 3692234 + 250 100.0 0.28 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
  • 12 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
761 chr2 3664715 3665280 phastConsElements100way lod=2669 score:774, srow:4377141
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
761 cellmeth_recounts PrEC: 61, LNCaP: 3, DU145: 9
761 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=95, B=2, Length=480, Event=Down, log2FC=-5.57, padj=0
761 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=95, B=9, Length=440, Event=Down, log2FC=-3.4, padj=0
761 cellexp id=ENSG00000118004, name=COLEC11, PrEC=0, str=2, LNCaP=2, str=3, DU145=1, str=0
761 cellexp id=ENSG00000188765, name=TMSB4XP2, PrEC=1, str=9, LNCaP=0, str=0, DU145=1, str=2
761 tcgameth site:cg23727927, B=0.95, L=0.96, H=0.95
761 tcgaexp gene=COLEC11, entrez=78989, pos=chr2:3642422-3692234(+), B=88, L=65, M=87, H=86