DMR 856 chr2:25642251-25642400 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:25642251-25642400 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesDTNB (0bp away)
ANODEV p-value0.0381821886454
FrequenciesBenign: 6.0 (85.71%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
856 DTNB 16101 uc002rgg.4 chr2 25600067 25705742 - 150 100.0 0.14 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (11.33), I6 (88.67), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgh.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (11.33), I16 (88.67), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgi.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (11.33), I16 (88.67), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgj.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 1.07 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (11.33), I16 (88.67), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgk.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.24 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (11.33), I15 (88.67), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgl.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.32 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (100), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgn.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.27 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (100), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgp.1 chr2 25606206 25650885 - 150 100.0 0.36 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgq.4 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 1.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (100), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc002rgr.1 chr2 25641965 25875530 - 150 100.0 4.63 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (100) 100.0
856 DTNB 16101 uc010yko.3 chr2 25600067 25873091 - 150 100.0 0.22 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (100), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc010ykp.3 chr2 25600067 25896516 - 150 100.0 0.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (100), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
856 DTNB 16101 uc031rns.1 chr2 25600067 25875530 - 150 100.0 0.17 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (100), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) 0.0
  • 13 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
856 chr2 25641637 25643221 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:948, expCount:17, expNums:104,105,123,124,130,131,306,307,308,326,328,330,332,336,338,340,602, expScores:415,374,265,284,254,434,527,136,230,872,241,294,401,192,285,296,167, srow:2126818
856 chr2 25641758 25642391 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 WRNIP1 score:147, expCount:1, expNums:320, expScores:126, srow:2126821
856 chr2 25641817 25642416 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MYC score:132, expCount:1, expNums:600, expScores:132, srow:2126825
856 chr2 25641877 25643005 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NFIC score:1000, expCount:1, expNums:97, expScores:1000, srow:2126827
856 chr2 25641929 25642338 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TBL1XR1 score:221, expCount:1, expNums:316, expScores:221, srow:2126830
856 chr2 25641943 25642281 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MTA3 score:377, expCount:1, expNums:95, expScores:377, srow:2126831
856 chr2 25641949 25642296 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 PAX5 score:413, expCount:4, expNums:100,101,122,129, expScores:413,411,132,134, srow:2126833
856 chr2 25641952 25642345 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RELA score:337, expCount:3, expNums:300,335,337, expScores:178,182,337, srow:2126834
856 chr2 25641987 25642396 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 STAT3 score:123, expCount:1, expNums:315, expScores:123, srow:2126836
856 chr2 25641992 25642307 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 YY1 score:237, expCount:1, expNums:133, expScores:237, srow:2126837
856 chr2 25642003 25642357 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RUNX3 score:407, expCount:1, expNums:109, expScores:407, srow:2126838
856 chr2 25642019 25642382 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 ELK1 score:188, expCount:1, expNums:293, expScores:188, srow:2126839
856 chr2 25642031 25642390 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 EBF1 score:379, expCount:2, expNums:86,292, expScores:253,379, srow:2126840
856 chr2 25642095 25642344 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 NRF1 score:148, expCount:1, expNums:303, expScores:148, srow:2126841
856 chr2 25642097 25642366 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 SMC3 score:202, expCount:1, expNums:313, expScores:202, srow:2126842
856 chr2 25642239 25642834 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 TCF7L2 score:219, expCount:1, expNums:581, expScores:219, srow:2126844
856 chr2 25642306 25642904 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 FOXM1 score:909, expCount:1, expNums:90, expScores:909, srow:2126845
856 chr2 25642340 25642929 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 IKZF1 score:194, expCount:1, expNums:294, expScores:194, srow:2126846
856 chr2 25642344 25642911 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MTA3 score:633, expCount:1, expNums:95, expScores:633, srow:2126847
856 chr2 25642360 25642983 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 RUNX3 score:1000, expCount:1, expNums:109, expScores:1000, srow:2126848
856 chr2 25642377 25642385 tfbsConsSites V$MSX1_01 score:931, zScore:2.38, srow:2571509
856 chr2 25642337 25642341 phastConsElements100way lod=38 score:354, srow:4436318
856 chr2 25642371 25642395 phastConsElements100way lod=231 score:532, srow:4436319
856 chr2 25642397 25642419 phastConsElements100way lod=127 score:473, srow:4436320
  • 24 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
856 cellmeth_recounts PrEC: 7, LNCaP: 0, DU145: 0
856 cellexp id=ENSG00000138101, name=DTNB, PrEC=1584, str=391, LNCaP=2754, str=1879, DU145=901, str=737
856 tcgaexp gene=DTNB, entrez=1838, pos=chr2:25600067-25896516(-), B=1877, L=2242, M=2150, H=1843