DMR 8595 chr18:30560451-30560650 (200bp)

DMR Stats
Positionchr18:30560451-30560650 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesCCDC178 (0bp away)
ANODEV p-value0.0484014699583
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
8595 CCDC178 13855 uc002kxn.2 chr18 30517366 31020045 - 200 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (100), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
8595 CCDC178 13855 uc002kxo.2 chr18 30517366 31020685 - 200 100.0 0.51 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (100), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
8595 CCDC178 13855 uc002kxp.3 chr18 30537971 31020685 - 200 100.0 0.34 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
8595 CCDC178 13855 uc010dme.1 chr18 30517366 30847016 - 200 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (100), E8 (0), I8 (0), E9 (0) 0.0
8595 CCDC178 13855 uc010dmf.1 chr18 30517366 31020045 - 200 100.0 0.35 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0) 0.0
8595 CCDC178 13855 uc010xbq.1 chr18 30517366 30716041 - 200 100.0 0.26 1 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0) 0.0
8595 CCDC178 13855 uc010xbr.1 chr18 30517366 31020045 - 200 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (100), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
8595 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 18
8595 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=0, B=26, Length=460, Event=Up, log2FC=Inf, padj=1.82506503014393e-07
8595 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=0, B=26.19, Length=580, Event=Up, log2FC=Inf, padj=5.19105390202517e-07
8595 cellexp id=ENSG00000166960, name=CCDC178, PrEC=3, str=0, LNCaP=0, str=1, DU145=0, str=0
8595 tcgaexp gene=CCDC178, entrez=374864, pos=chr18:30517366-31020685(-), B=201, L=96, M=64, H=42