DMR 874 chr2:30966251-30966400 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:30966251-30966400 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextpromoter
Nearest GenesCAPN13 (0bp away)
ANODEV p-value0.0238875566472
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 6.0 (100.0%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
874 CAPN13 16195 uc002rnm.3 chr2 30945638 30966445 - 150 100.0 0.81 1 100.0 E1 (100), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
874 CAPN13 16195 uc002rno.3 chr2 30964240 30966445 - 150 100.0 0.84 0 100.0 E1 (100), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0) 0.0
874 CAPN13 16195 uc021vfm.1 chr2 30945638 31030311 - 150 100.0 3.03 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0) 0.0
874 CAPN13 16195 uc021vfn.1 chr2 30953596 31010223 - 150 100.0 2.88 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0) 0.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
874 chr2 30966242 30966254 tfbsConsSites V$AREB6_01 score:902, zScore:2.04, srow:2585822
874 chr2 30966271 30966280 tfbsConsSites V$HSF1_01 score:936, zScore:2.61, srow:2585823
874 chr2 30966271 30966280 tfbsConsSites V$HSF2_01 score:982, zScore:2.87, srow:2585824
874 chr2 30966308 30966321 tfbsConsSites V$CEBPA_01 score:875, zScore:1.65, srow:2585825
874 chr2 30966327 30966342 tfbsConsSites V$ARP1_01 score:809, zScore:2.07, srow:2585826
874 chr2 30966322 30966322 cosmic COSM1531757 srow:640141
874 chr2 30966341 30966341 cosmic COSM1531756 srow:640142
874 chr2 30966366 30966366 cosmic COSM395971 srow:640143
874 chr2 30966366 30966366 cosmic COSM1020059 srow:640144
874 chr2 30966367 30966367 cosmic COSM392978 srow:640145
874 chr2 30966368 30966368 cosmic COSM1718318 srow:640146
874 chr2 30966375 30966375 cosmic COSM1020061 srow:640147
874 chr2 30966381 30966381 cosmic COSM1718319 srow:640148
874 chr2 30966246 30966251 phastConsElements100way lod=37 score:351, srow:4462137
874 chr2 30966267 30966289 phastConsElements100way lod=91 score:440, srow:4462138
874 chr2 30966327 30966334 phastConsElements100way lod=45 score:370, srow:4462139
874 chr2 30966336 30966337 phastConsElements100way lod=13 score:247, srow:4462140
874 chr2 30966341 30966343 phastConsElements100way lod=17 score:274, srow:4462141
874 chr2 30966357 30966364 phastConsElements100way lod=24 score:308, srow:4462142
  • 19 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
874 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 3, DU145: 3
874 cellexp id=ENSG00000162949, name=CAPN13, PrEC=5, str=130, LNCaP=986, str=724, DU145=1, str=4
874 tcgaexp gene=CAPN13, entrez=92291, pos=chr2:30945638-31030311(-), B=279, L=192, M=207, H=173