DMR 8768 chr18:77124201-77124350 (150bp)

DMR Stats
Positionchr18:77124201-77124350 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesATP9B (0bp away)
ANODEV p-value0.00141108845456
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
8768 ATP9B 14075 uc002lmw.1 chr18 76829397 77137628 + 150 100.0 0.38 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (100), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0) 0.0
8768 ATP9B 14075 uc002lmx.3 chr18 76829397 77138282 + 150 100.0 0.76 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (100), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
8768 ATP9B 14075 uc002lna.3 chr18 77104265 77138282 + 150 100.0 0.38 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (100), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
8768 ATP9B 14075 uc002lnb.1 chr18 77105428 77134197 + 150 100.0 0.76 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0) 0.0
8768 ATP9B 14075 uc010drb.3 chr18 77107770 77138282 + 150 100.0 0.99 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (100), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
8768 chr18 77123677 77125676 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:21811
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
8768 cellmeth_recounts PrEC: 7, LNCaP: 1, DU145: 10
8768 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=20, B=1, Length=280, Event=Down, log2FC=-4.32, padj=0.000246010682141716
8768 cellexp id=ENSG00000166377, name=ATP9B, PrEC=1005, str=1276, LNCaP=1438, str=1097, DU145=1437, str=1057
8768 tcgaexp gene=ATP9B, entrez=374868, pos=chr18:76829397-77138282(+), B=1636, L=1428, M=1474, H=1377