DMR 887 chr2:33786801-33786950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr2:33786801-33786950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRASGRP3 (0bp away)
ANODEV p-value0.0440380631721
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 4.0 (66.67%), High: 3.0 (33.33 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
887 RASGRP3 16217 uc002rox.3 chr2 33661416 33789798 + 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (100), E19 (0) 0.0
887 RASGRP3 16217 uc002roy.3 chr2 33738942 33789798 + 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (100), E17 (0) 0.0
887 RASGRP3 16217 uc010ync.2 chr2 33701321 33789798 + 150 100.0 0.26 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (100), E18 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
887 chr2 33786946 33787185 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 MAFK score:208, expCount:1, expNums:437, expScores:208, srow:2144130
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
887 cellmeth_recounts PrEC: 0, LNCaP: 0, DU145: 3
887 cellexp id=ENSG00000152689, name=RASGRP3, PrEC=3, str=37, LNCaP=0, str=2, DU145=89, str=156
887 cellexp id=ENSG00000237133, name=AC020594.5, PrEC=2, str=21, LNCaP=1, str=0, DU145=3, str=3
887 tcgaexp gene=RASGRP3, entrez=25780, pos=chr2:33661416-33789798(+), B=209, L=169, M=193, H=292