DMR Stats
Positionchr1:8775551-8775700 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRERE (0bp away)
ANODEV p-value0.0305685533819
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 3.0 (50.0%), High: 2.0 (22.22 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
92 RERE 171 uc001ape.3 chr1 8412464 8877699 - 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
92 RERE 171 uc001apf.3 chr1 8412464 8877699 - 150 100.0 0.01 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
92 RERE 171 uc001aph.1 chr1 8525030 8813897 - 150 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
92 cellmeth_recounts PrEC: 2, LNCaP: 14, DU145: 12
92 cellexp id=ENSG00000142599, name=RERE, PrEC=6064, str=5062, LNCaP=2677, str=2048, DU145=3741, str=3492
92 tcgaexp gene=RERE, entrez=473, pos=chr1:8412464-8877699(-), B=16405, L=21660, M=21844, H=23766
92 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
92 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305