DMR 93 chr1:8807051-8807250 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:8807051-8807250 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesRERE (0bp away)
ANODEV p-value8.23957050887e-05
FrequenciesBenign: 2.0 (28.57%), Low: 6.0 (100.0%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
93 RERE 171 uc001ape.3 chr1 8412464 8877699 - 200 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (100), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0) 0.0
93 RERE 171 uc001apf.3 chr1 8412464 8877699 - 200 100.0 0.13 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0) 0.0
93 RERE 171 uc001aph.1 chr1 8525030 8813897 - 200 100.0 0.18 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0) 0.0
  • 3 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
93 chr1 8806601 8807110 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 30 score:264, srow:7055
  • 1 features

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
93 cellmeth_recounts PrEC: 3, LNCaP: 5, DU145: 5
93 cellexp id=ENSG00000142599, name=RERE, PrEC=6064, str=5062, LNCaP=2677, str=2048, DU145=3741, str=3492
93 tcgaexp gene=RERE, entrez=473, pos=chr1:8412464-8877699(-), B=16405, L=21660, M=21844, H=23766
93 tcgaexp gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019
93 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305