DMR 26655 chr2:213400951-213401600 (650bp)

DMR Stats
Positionchr2:213400951-213401600 (View on UCSC)
Width650bp
Genomic Contextintron
Nearest GenesERBB4 (0bp away)
ANODEV p-value1.38896347895e-08
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 5.0 (83.33%), High: 6.0 (66.67 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
26655 ERBB4 17544 uc002veg.1 chr2 212240442 213403352 - 650 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
26655 ERBB4 17544 uc002veh.1 chr2 212240442 213403352 - 650 100.0 0.25 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
26655 ERBB4 17544 uc010fut.1 chr2 212426487 213403352 - 650 100.0 0.07 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0) 0.0
26655 ERBB4 17544 uc010zji.1 chr2 212240442 213403352 - 650 100.0 0.19 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
26655 ERBB4 17544 uc010zjj.1 chr2 212240442 213403352 - 650 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
  • 5 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
26655 chr2 213400972 213400978 phastConsElements100way lod=24 score:308, srow:5122139
26655 chr2 213401006 213401024 phastConsElements100way lod=53 score:387, srow:5122140
26655 chr2 213401068 213401075 phastConsElements100way lod=32 score:337, srow:5122141
26655 chr2 213401077 213401085 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:5122142
26655 chr2 213401088 213401099 phastConsElements100way lod=47 score:375, srow:5122143
26655 chr2 213401107 213401130 phastConsElements100way lod=46 score:373, srow:5122144
26655 chr2 213401136 213401139 phastConsElements100way lod=16 score:268, srow:5122145
26655 chr2 213401143 213401233 phastConsElements100way lod=329 score:567, srow:5122146
26655 chr2 213401236 213401259 phastConsElements100way lod=103 score:452, srow:5122147
26655 chr2 213401264 213401300 phastConsElements100way lod=143 score:485, srow:5122148
26655 chr2 213401311 213401319 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:5122149
26655 chr2 213401327 213401336 phastConsElements100way lod=37 score:351, srow:5122150
26655 chr2 213401339 213401343 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:5122151
26655 chr2 213401349 213401432 phastConsElements100way lod=448 score:598, srow:5122152
26655 chr2 213401438 213401471 phastConsElements100way lod=59 score:397, srow:5122153
26655 chr2 213401497 213401527 phastConsElements100way lod=68 score:411, srow:5122154
26655 chr2 213401533 213401556 phastConsElements100way lod=69 score:413, srow:5122155
26655 chr2 213401559 213401563 phastConsElements100way lod=21 score:295, srow:5122156
26655 chr2 213401572 213401609 phastConsElements100way lod=164 score:498, srow:5122157
26655 chr2 213400181 213402180 cpgShore — values(x.gr)[overs$srow, ]:28673

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
26655 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 60, DU145: 3
26655 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=4, B=44, Length=560, Event=Up, log2FC=3.46, padj=3.18073309507325e-08
26655 cellmeth_diffreps_LNCaPvsDU145 A=57.73, B=0.94, Length=700, Event=Down, log2FC=-5.95, padj=0
26655 cellexp id=ENSG00000178568, name=ERBB4, PrEC=4, str=21, LNCaP=7, str=8, DU145=1, str=2
26655 tcgameth site:cg00326719, B=0.25, L=0.49, H=0.48
26655 tcgameth site:cg07536926, B=0.19, L=0.42, H=0.43
26655 tcgameth site:cg11058366, B=0.28, L=0.58, H=0.55
26655 tcgameth site:cg12281565, B=0.26, L=0.49, H=0.5
26655 tcgameth site:cg20215622, B=0.13, L=0.33, H=0.28
26655 tcgaexp gene=ERBB4, entrez=2066, pos=chr2:212240442-213403352(-), B=376, L=84, M=121, H=117