DMR 36835 chr1:111862901-111863100 (200bp)

DMR Stats
Positionchr1:111862901-111863100 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesCHIA (0bp away)
ANODEV p-value0.012972844459
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 2.0 (33.33%), High: 8.0 (88.89 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
36835 CHIA 1320 uc001eaq.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.08 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (100) 100.0
36835 CHIA 1320 uc001ear.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.05 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (100) 100.0
36835 CHIA 1320 uc001eas.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 100.0
36835 CHIA 1320 uc001eat.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (100) 100.0
36835 CHIA 1320 uc001eau.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100) 100.0
36835 CHIA 1320 uc001eav.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (100) 100.0
36835 CHIA 1320 uc009wgc.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (100) 100.0
36835 CHIA 1320 uc009wgd.4 chr1 111833474 111863188 + 200 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (100) 100.0
  • 8 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
36835 chr1 111862966 111862973 phastConsElements100way lod=28 score:323, srow:462233
36835 chr1 111862996 111863001 phastConsElements100way lod=35 score:345, srow:462234
36835 chr1 111863005 111863006 phastConsElements100way lod=23 score:304, srow:462235
36835 chr1 111863014 111863015 phastConsElements100way lod=27 score:320, srow:462236
36835 chr1 111863035 111863036 phastConsElements100way lod=24 score:308, srow:462237
36835 chr1 111863050 111863057 phastConsElements100way lod=28 score:323, srow:462238
36835 chr1 111863064 111863066 phastConsElements100way lod=32 score:337, srow:462239
36835 chr1 111863071 111863082 phastConsElements100way lod=89 score:438, srow:462240

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
36835 cellmeth_recounts PrEC: 4, LNCaP: 3, DU145: 1
36835 cellexp id=ENSG00000134216, name=CHIA, PrEC=0, str=0, LNCaP=0, str=0, DU145=1, str=0
36835 cellexp id=ENSG00000229283, name=RP5-1125M8.2, PrEC=0, str=0, LNCaP=0, str=0, DU145=0, str=0
36835 tcgaexp gene=CHIA, entrez=27159, pos=chr1:111833474-111863188(+), B=11, L=0, M=0, H=0
36835 tcgaexp gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305