DMR 37109 chr2:15307201-15307400 (200bp)

DMR Stats
Positionchr2:15307201-15307400 (View on UCSC)
Width200bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesNBAS (0bp away)
ANODEV p-value0.000853981831125
FrequenciesBenign: 1.0 (14.29%), Low: 2.0 (33.33%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37109 NBAS 16044 uc002rcb.1 chr2 15307032 15378818 - 200 100.0 0.37 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (100) 100.0
37109 NBAS 16044 uc002rcc.2 chr2 15307032 15701472 - 200 100.0 2.84 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (100) 100.0
37109 NBAS 16044 uc002rcd.2 chr2 15307032 15701472 - 200 100.0 0.9 1 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (100) 100.0
37109 NBAS 16044 uc010exl.1 chr2 15307032 15564592 - 200 100.0 0.33 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (100) 100.0
  • 4 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37109 chr2 15307311 15307315 phastConsElements100way lod=49 score:379, srow:4400077
37109 chr2 15307329 15307338 phastConsElements100way lod=67 score:410, srow:4400078
37109 chr2 15307341 15307347 phastConsElements100way lod=86 score:434, srow:4400079
37109 chr2 15307350 15307350 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:4400080
37109 chr2 15307353 15307354 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:4400081
37109 chr2 15307357 15307357 phastConsElements100way lod=14 score:255, srow:4400082
37109 chr2 15307359 15307369 phastConsElements100way lod=109 score:458, srow:4400083
37109 chr2 15307371 15307377 phastConsElements100way lod=67 score:410, srow:4400084
37109 chr2 15307380 15307393 phastConsElements100way lod=72 score:417, srow:4400085
37109 chr2 15307398 15307399 phastConsElements100way lod=18 score:280, srow:4400086

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37109 cellmeth_recounts PrEC: 6, LNCaP: 0, DU145: 1
37109 cellexp id=ENSG00000151779, name=NBAS, PrEC=4064, str=5220, LNCaP=1528, str=1766, DU145=3949, str=2887
37109 tcgaexp gene=NBAS, entrez=51594, pos=chr2:15307032-15701472(-), B=3164, L=3208, M=3159, H=3057
37109 pubmed gene=NBAS, G=160, GP=0, GC=7, GM=0, GPM=0, GCM=0