DMR Stats | |
---|---|
Position | chr1:2058751-2059050 (View on UCSC) |
Width | 300bp |
Genomic Context | intron |
Nearest Genes | PRKCZ (0bp away) |
ANODEV p-value | 0.000185426501915 |
Frequencies | Benign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %) |
Frequent? |
Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
36512 | PRKCZ | 94 | uc001aiq.3 | chr1 | 1981909 | 2116834 | + | 300 | 100.0 | 0.32 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (100), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
36512 | PRKCZ | 94 | uc001air.3 | chr1 | 2005086 | 2116834 | + | 300 | 100.0 | 1.53 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) | 0.0 |
36512 | PRKCZ | 94 | uc001ais.3 | chr1 | 2036155 | 2116834 | + | 300 | 100.0 | 1.56 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) | 0.0 |
36512 | PRKCZ | 94 | uc010nyw.2 | chr1 | 2005425 | 2116834 | + | 300 | 100.0 | 1.24 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (100), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0) | 0.0 |
Dmrid | Feature Chr | Feature Start | Feature End | Set | Name | Fields |
---|---|---|---|---|---|---|
36512 | chr1 | 2058586 | 2059050 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 18 | score:427, srow:1234 |
36512 | chr1 | 2058604 | 2058879 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | MAX | score:188, expCount:1, expNums:576, expScores:188, srow:6137 |
36512 | chr1 | 2058796 | 2058807 | tfbsConsSites | V$NFKB_C | score:910, zScore:2.8, srow:3023 |
Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
---|---|---|---|
36512 | cellmeth_recounts | PrEC: 0, LNCaP: 1, DU145: 9 | |
36512 | cellexp | id=ENSG00000067606, name=PRKCZ, PrEC=1187, str=1283, LNCaP=1606, str=1028, DU145=964, str=723 | |
36512 | tcgameth | site:cg18188739, B=0.41, L=0.66, H=0.63 | |
36512 | tcgaexp | gene=PRKCZ, entrez=5590, pos=chr1:1981909-2116834(+), B=1809, L=2383, M=2268, H=1943 | |
36512 | tcgaexp | gene=SRSF10, entrez=10772, pos=chr1:36273-24306953(-), B=3487, L=3388, M=3432, H=4019 | |
36512 | tcgaexp | gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305 | |
36512 | pubmed | gene=PRKCZ, G=65, GP=2, GC=10, GM=2, GPM=0, GCM=0 |