DMR 11094 chr1:204945801-204945950 (150bp)

DMR Stats
Positionchr1:204945801-204945950 (View on UCSC)
Width150bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesNFASC (0bp away)
ANODEV p-value0.00264366897268
FrequenciesBenign: 5.0 (71.43%), Low: 1.0 (16.67%), High: 9.0 (100.0 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
11094 NFASC 2437 uc001hbh.3 chr1 204797782 204946274 + 150 100.0 0.16 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (100) 100.0
11094 NFASC 2437 uc001hbi.3 chr1 204797782 204991950 + 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (82), I16 (18.67), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
11094 NFASC 2437 uc001hbj.3 chr1 204797782 204991950 + 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (82), I16 (18.67), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0) 0.0
11094 NFASC 2437 uc001hbk.1 chr1 204926784 204959691 + 150 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (82), I9 (18.67), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0) 0.0
11094 NFASC 2437 uc010pqz.2 chr1 204797782 204946274 + 150 100.0 0.12 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (100) 100.0
11094 NFASC 2437 uc010pra.2 chr1 204797782 204991950 + 150 100.0 0.18 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (82), I16 (18.67), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0) 0.0
11094 NFASC 2437 uc010prb.2 chr1 204913354 204991950 + 150 100.0 0.15 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (82), I14 (18.67), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
11094 NFASC 2437 uc010prc.2 chr1 204913354 204991950 + 150 100.0 10.48 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (82), I15 (18.67), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0) 0.0
  • 8 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
11094 chr1 204945794 204945810 phastConsElements100way lod=201 score:518, srow:727049
11094 chr1 204945812 204945813 phastConsElements100way lod=31 score:333, srow:727050
11094 chr1 204945815 204945816 phastConsElements100way lod=35 score:345, srow:727051
11094 chr1 204945818 204945831 phastConsElements100way lod=80 score:427, srow:727052
11094 chr1 204945833 204945834 phastConsElements100way lod=27 score:320, srow:727053
11094 chr1 204945836 204945840 phastConsElements100way lod=68 score:411, srow:727054
11094 chr1 204945847 204945847 cosmic COSM349931 srow:102793
11094 chr1 204945847 204945847 cosmic COSM349932 srow:102794
11094 chr1 204945840 204945852 tfbsConsSites V$PAX3_01 score:807, zScore:1.89, srow:424748
11094 chr1 204945842 204945855 phastConsElements100way lod=164 score:498, srow:727055
11094 chr1 204945860 204945864 phastConsElements100way lod=70 score:414, srow:727056
11094 chr1 204945866 204945867 phastConsElements100way lod=41 score:361, srow:727057
11094 chr1 204945859 204945870 tfbsConsSites V$NMYC_01 score:878, zScore:1.73, srow:424751
11094 chr1 204945872 204945872 cosmic COSM1583950 srow:102795
11094 chr1 204945872 204945872 cosmic COSM902667 srow:102796
11094 chr1 204945872 204945872 cosmic COSM902668 srow:102797
11094 chr1 204945855 204945874 tfbsConsSites V$ARNT_02 score:795, zScore:2.02, srow:424749
11094 chr1 204945855 204945874 tfbsConsSites V$MYCMAX_03 score:828, zScore:2.34, srow:424750
11094 chr1 204945872 204945879 phastConsElements100way lod=78 score:425, srow:727058
11094 chr1 204945881 204945891 phastConsElements100way lod=130 score:475, srow:727059
11094 chr1 204945893 204945893 cosmic COSM1338120 srow:102798
11094 chr1 204945893 204945893 cosmic COSM1338118 srow:102799
11094 chr1 204945893 204945893 cosmic COSM1338119 srow:102800
11094 chr1 204945884 204945907 tfbsConsSites V$HTF_01 score:765, zScore:1.77, srow:424752
11094 chr1 204945907 204945907 cosmic COSM1583949 srow:102801
  • Page 1 of 2
  • 25 of 34 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
11094 cellmeth_recounts PrEC: 5, LNCaP: 0, DU145: 0
11094 cellexp id=ENSG00000163531, name=NFASC, PrEC=218, str=478, LNCaP=179, str=211, DU145=700, str=335
11094 tcgaexp gene=NFASC, entrez=23114, pos=chr1:204797782-204991950(+), B=1717, L=1078, M=1035, H=1128