DMR 25571 chr1:145562651-145563150 (500bp)
| DMR Stats | |
|---|---|
| Position | chr1:145562651-145563150 (View on UCSC) |
| Width | 500bp |
| Genomic Context | 3' end |
| Nearest Genes | ANKRD35, LOC100288142, NBPF10 (0bp away) |
| ANODEV p-value | 1.43314624821e-05 |
| Frequencies | Benign: 0.0 (0.0%), Low: 6.0 (100.0%), High: 7.0 (77.78 %) |
| Frequent? |
Region Count Boxplot
Region Overview
Gene Overlaps
| Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25571 | ANKRD35 | 1504 | uc001eob.1 | chr1 | 145549209 | 145568526 | + | 500 | 100.0 | 0.07 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (89.8), I10 (10.4), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0) | 0.0 |
| 25571 | ANKRD35 | 1504 | uc010oyx.1 | chr1 | 145549209 | 145563099 | + | 449 | 89.8 | 0.05 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (89.8) | 100.0 |
| 25571 | LOC100288142 | 1460 | uc021ott.2 | chr1 | 144146811 | 146467744 | + | 500 | 100.0 | 0.28 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (0), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0), I74 (0), E75 (0), I75 (0), E76 (0), I76 (0), E77 (0), I77 (0), E78 (0), I78 (0), E79 (0), I79 (0), E80 (0), I80 (0), E81 (0), I81 (0), E82 (0), I82 (0), E83 (0), I83 (0), E84 (0), I84 (0), E85 (0), I85 (0), E86 (0), I86 (0), E87 (0), I87 (0), E88 (0), I88 (0), E89 (0), I89 (0), E90 (0), I90 (0), E91 (0), I91 (0), E92 (0), I92 (0), E93 (0), I93 (0), E94 (0), I94 (0), E95 (0), I95 (0), E96 (0), I96 (0), E97 (0), I97 (0), E98 (0), I98 (0), E99 (0), I99 (100), E100 (0), I100 (0), E101 (0), I101 (0), E102 (0), I102 (0), E103 (0), I103 (0), E104 (0), I104 (0), E105 (0), I105 (0), E106 (0), I106 (0), E107 (0), I107 (0), E108 (0), I108 (0), E109 (0), I109 (0), E110 (0), I110 (0), E111 (0), I111 (0), E112 (0), I112 (0), E113 (0), I113 (0), E114 (0), I114 (0), E115 (0), I115 (0), E116 (0), I116 (0), E117 (0), I117 (0), E118 (0), I118 (0), E119 (0), I119 (0), E120 (0), I120 (0), E121 (0), I121 (0), E122 (0), I122 (0), E123 (0), I123 (0), E124 (0), I124 (0), E125 (0), I125 (0), E126 (0), I126 (0), E127 (0), I127 (0), E128 (0), I128 (0), E129 (0), I129 (0), E130 (0), I130 (0), E131 (0), I131 (0), E132 (0) | 0.0 |
| 25571 | NBPF10 | 1460 | uc031poc.1 | chr1 | 145293371 | 146467744 | + | 500 | 100.0 | 0.21 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (0), E20 (0), I20 (0), E21 (0), I21 (0), E22 (0), I22 (0), E23 (0), I23 (0), E24 (0), I24 (0), E25 (0), I25 (0), E26 (0), I26 (0), E27 (0), I27 (0), E28 (0), I28 (0), E29 (0), I29 (0), E30 (0), I30 (0), E31 (0), I31 (0), E32 (0), I32 (0), E33 (0), I33 (0), E34 (0), I34 (0), E35 (0), I35 (0), E36 (0), I36 (0), E37 (0), I37 (0), E38 (0), I38 (0), E39 (0), I39 (0), E40 (0), I40 (0), E41 (0), I41 (0), E42 (0), I42 (0), E43 (0), I43 (0), E44 (0), I44 (0), E45 (0), I45 (0), E46 (0), I46 (0), E47 (0), I47 (0), E48 (0), I48 (0), E49 (0), I49 (0), E50 (0), I50 (0), E51 (0), I51 (0), E52 (0), I52 (0), E53 (0), I53 (0), E54 (0), I54 (0), E55 (0), I55 (0), E56 (0), I56 (0), E57 (0), I57 (0), E58 (0), I58 (0), E59 (0), I59 (0), E60 (0), I60 (0), E61 (0), I61 (0), E62 (0), I62 (0), E63 (0), I63 (0), E64 (0), I64 (0), E65 (0), I65 (0), E66 (0), I66 (0), E67 (0), I67 (0), E68 (0), I68 (100), E69 (0), I69 (0), E70 (0), I70 (0), E71 (0), I71 (0), E72 (0), I72 (0), E73 (0), I73 (0), E74 (0), I74 (0), E75 (0), I75 (0), E76 (0), I76 (0), E77 (0), I77 (0), E78 (0), I78 (0), E79 (0), I79 (0), E80 (0), I80 (0), E81 (0), I81 (0), E82 (0), I82 (0), E83 (0), I83 (0), E84 (0), I84 (0), E85 (0), I85 (0), E86 (0) | 0.0 |
- 4 geness
Feature Overlaps
| Dmrid | Feature Chr | Feature Start | Feature End | Set | Name | Fields |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 25571 | chr1 | 145562379 | 145562978 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | CTBP2 | score:123, expCount:1, expNums:348, expScores:123, srow:239143 |
| 25571 | chr1 | 145562632 | 145563007 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | TBP | score:149, expCount:1, expNums:359, expScores:149, srow:239146 |
| 25571 | chr1 | 145562464 | 145563193 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | POLR2A | score:171, expCount:2, expNums:577,610, expScores:169,171, srow:239144 |
| 25571 | chr1 | 145562866 | 145563147 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | EGR1 | score:213, expCount:2, expNums:87,138, expScores:213,155, srow:239148 |
| 25571 | chr1 | 145562885 | 145563125 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | CTCF | score:245, expCount:5, expNums:597,604,605,607,636, expScores:149,245,236,242,120, srow:239149 |
| 25571 | chr1 | 145562947 | 145562948 | phastConsElements100way | lod=14 | score:255, srow:511600 |
| 25571 | chr1 | 145562899 | 145562900 | phastConsElements100way | lod=15 | score:262, srow:511595 |
| 25571 | chr1 | 145562902 | 145562903 | phastConsElements100way | lod=15 | score:262, srow:511596 |
| 25571 | chr1 | 145562893 | 145562894 | phastConsElements100way | lod=16 | score:268, srow:511594 |
| 25571 | chr1 | 145562908 | 145562909 | phastConsElements100way | lod=16 | score:268, srow:511597 |
| 25571 | chr1 | 145563045 | 145563047 | phastConsElements100way | lod=16 | score:268, srow:511608 |
| 25571 | chr1 | 145562698 | 145562699 | phastConsElements100way | lod=17 | score:274, srow:511580 |
| 25571 | chr1 | 145562872 | 145562875 | phastConsElements100way | lod=19 | score:285, srow:511591 |
| 25571 | chr1 | 145563040 | 145563042 | phastConsElements100way | lod=21 | score:295, srow:511607 |
| 25571 | chr1 | 145563001 | 145563003 | phastConsElements100way | lod=25 | score:312, srow:511603 |
| 25571 | chr1 | 145562521 | 145563190 | wgEncodeRegTfbsClusteredV3 | RBBP5 | score:317, expCount:1, expNums:8, expScores:317, srow:239145 |
| 25571 | chr1 | 145562887 | 145562891 | phastConsElements100way | lod=28 | score:323, srow:511593 |
| 25571 | chr1 | 145563005 | 145563017 | phastConsElements100way | lod=28 | score:323, srow:511604 |
| 25571 | chr1 | 145562851 | 145562855 | phastConsElements100way | lod=30 | score:330, srow:511589 |
| 25571 | chr1 | 145563028 | 145563032 | phastConsElements100way | lod=32 | score:337, srow:511606 |
| 25571 | chr1 | 145562779 | 145562784 | phastConsElements100way | lod=34 | score:343, srow:511585 |
| 25571 | chr1 | 145562956 | 145562966 | phastConsElements100way | lod=34 | score:343, srow:511601 |
| 25571 | chr1 | 145563020 | 145563026 | phastConsElements100way | lod=37 | score:351, srow:511605 |
| 25571 | chr1 | 145562921 | 145562930 | phastConsElements100way | lod=38 | score:354, srow:511598 |
| 25571 | chr1 | 145562755 | 145562765 | phastConsElements100way | lod=39 | score:356, srow:511583 |
- Page 1 of 3
- Next
- 25 of 67 featuress
Omics Overlaps
| Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
|---|---|---|---|
| 25571 | cellmeth_recounts | PrEC: 7, LNCaP: 33, DU145: 47 |  |
| 25571 | cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 | A=0, B=15, Length=240, Event=Up, log2FC=Inf, padj=0.000269565104641442 |  |
| 25571 | cellexp | id=ENSG00000198483, name=ANKRD35, PrEC=107, str=27, LNCaP=2, str=0, DU145=0, str=0 |  |
| 25571 | tcgameth | site:cg01000615, B=0.3, L=0.56, H=0.54 |  |
| 25571 | tcgameth | site:cg11187916, B=0.35, L=0.5, H=0.49 |  |
| 25571 | tcgaexp | gene=ANKRD35, entrez=148741, pos=chr1:145549209-145568526(+), B=618, L=493, M=332, H=227 |  |
| 25571 | tcgaexp | gene=NBPF9, entrez=400818, pos=chr1:144146811-148346929(-), B=433, L=627, M=621, H=693 |  |
| 25571 | tcgaexp | gene=PPIAL4B, entrez=653505, pos=chr1:144363462-149553787(-), B=0, L=0, M=0, H=0 |  |
| 25571 | tcgaexp | gene=LINC00623, entrez=728855, pos=chr1:144300512-149616786(-), B=727, L=966, M=1062, H=1250 |  |
| 25571 | tcgaexp | gene=NBPF10, entrez=100132406, pos=chr1:145209111-146467744(+), B=1460, L=1441, M=1448, H=1446 |  |
| 25571 | tcgaexp | gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305 |  |