DMR 37009 chr1:227173601-227174300 (700bp)

DMR Stats
Positionchr1:227173601-227174300 (View on UCSC)
Width700bp
Genomic Context3' end
Nearest GenesADCK3 (0bp away)
ANODEV p-value8.336350857e-06
FrequenciesBenign: 0.0 (0.0%), Low: 2.0 (33.33%), High: 7.0 (77.78 %)
Frequent?

Region Count Boxplot

Region Overview

Gene Overlaps

Dmrid Gene Symbol Gene Id Isoform Id Isoform Chr Isoform Start Isoform End Isoform Strand Overlap Bp Query Overlap Per Isoform Overlap Per Noncoding Promoter Per Exonintron Per End Per
37009 ADCK3 2643 uc001hqm.1 chr1 227084589 227175246 + 700 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0), I18 (0), E19 (0), I19 (79), E20 (21) 7.71
37009 ADCK3 2643 uc001hqn.1 chr1 227127938 227175246 + 700 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (79), E15 (21) 7.71
37009 ADCK3 2643 uc001hqo.1 chr1 227165105 227175246 + 700 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (79), E11 (21) 7.71
37009 ADCK3 2643 uc009xeq.1 chr1 227127938 227175246 + 700 100.0 0.09 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (79), E15 (21) 7.71
37009 ADCK3 2643 uc009xer.1 chr1 227170595 227175246 + 700 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (79), E7 (21) 7.71
37009 ADCK3 2643 uc010pvq.1 chr1 227127938 227175246 + 700 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (0), E11 (0), I11 (79), E12 (21) 7.71
37009 ADCK3 2643 uc010pvr.1 chr1 227153372 227175246 + 700 100.0 0.06 0 0.0 E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (0), E10 (0), I10 (79), E11 (21) 7.71
  • 7 geness

Feature Overlaps

Dmrid Feature Chr Feature Start Feature End Set Name Fields
37009 chr1 227173470 227173965 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 HMGN3 score:130, expCount:1, expNums:501, expScores:130, srow:399291
37009 chr1 227174268 227174269 phastConsElements100way lod=30 score:330, srow:807267
37009 chr1 227174298 227174299 phastConsElements100way lod=30 score:330, srow:807270
37009 chr1 227174205 227174209 phastConsElements100way lod=32 score:337, srow:807261
37009 chr1 227174214 227174218 phastConsElements100way lod=32 score:337, srow:807262
37009 chr1 227174202 227174203 phastConsElements100way lod=36 score:348, srow:807260
37009 chr1 227174286 227174795 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 17 score:350, srow:108424
37009 chr1 227174293 227174296 phastConsElements100way lod=37 score:351, srow:807269
37009 chr1 227174229 227174230 phastConsElements100way lod=44 score:368, srow:807264
37009 chr1 227174220 227174227 phastConsElements100way lod=92 score:441, srow:807263
37009 chr1 227174196 227174200 phastConsElements100way lod=94 score:443, srow:807259
37009 chr1 227173566 227174215 wgEncodeRegDnaseClusteredV2 23 score:455, srow:108423
37009 chr1 227174166 227174176 phastConsElements100way lod=121 score:468, srow:807257
37009 chr1 227174235 227174245 phastConsElements100way lod=121 score:468, srow:807265
37009 chr1 227174152 227174164 phastConsElements100way lod=146 score:487, srow:807256
37009 chr1 227174247 227174266 phastConsElements100way lod=209 score:522, srow:807266
37009 chr1 227174272 227174290 phastConsElements100way lod=212 score:524, srow:807268
37009 chr1 227174178 227174194 phastConsElements100way lod=236 score:534, srow:807258
37009 chr1 227172082 227174706 wgEncodeRegTfbsClusteredV3 POLR2A score:613, expCount:5, expNums:32,61,62,229,522, expScores:190,244,201,613,192, srow:399290
37009 chr1 227174215 227174243 tfbsConsSites V$MYOGNF1_01 score:739, zScore:1.74, srow:473964
37009 chr1 227174166 227174179 tfbsConsSites V$ROAZ_01 score:745, zScore:1.74, srow:473961
37009 chr1 227174183 227174201 tfbsConsSites V$PAX2_01 score:781, zScore:1.94, srow:473963
37009 chr1 227174260 227174277 tfbsConsSites V$CART1_01 score:791, zScore:1.83, srow:473965
37009 chr1 227174290 227174302 tfbsConsSites V$PAX3_01 score:808, zScore:1.91, srow:473968
37009 chr1 227174174 227174186 tfbsConsSites V$CHOP_01 score:836, zScore:1.84, srow:473962
  • Page 1 of 2
  • 25 of 38 featuress

Omics Overlaps

Dmrid Omic Set Data Plot
37009 cellmeth_recounts PrEC: 43, LNCaP: 10, DU145: 3
37009 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=40, B=5, Length=380, Event=Down, log2FC=-3, padj=1.62084981826649e-06
37009 cellmeth_diffreps_PrECvsLNCaP A=36, B=1, Length=460, Event=Down, log2FC=-5.17, padj=6.94455790086297e-09
37009 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=40, B=2, Length=400, Event=Down, log2FC=-4.32, padj=9.27312367715555e-09
37009 cellmeth_diffreps_PrECvsDU145 A=31, B=1, Length=400, Event=Down, log2FC=-4.95, padj=2.42525854690887e-07
37009 cellexp id=ENSG00000163050, name=ADCK3, PrEC=389, str=304, LNCaP=8696, str=8679, DU145=830, str=653
37009 tcgaexp gene=ADCK3, entrez=56997, pos=chr1:227084589-227175246(+), B=4622, L=6253, M=5729, H=5109
37009 pubmed gene=ADCK3, G=17, GP=0, GC=0, GM=0, GPM=0, GCM=0