DMR Stats | |
---|---|
Position | chr1:51768101-51768250 (View on UCSC) |
Width | 150bp |
Genomic Context | 3' end |
Nearest Genes | TTC39A (0bp away) |
ANODEV p-value | 0.000481649500074 |
Frequencies | Benign: 0.0 (0.0%), Low: 0.0 (0.0%), High: 6.0 (66.67 %) |
Frequent? |
Dmrid | Gene Symbol | Gene Id | Isoform Id | Isoform Chr | Isoform Start | Isoform End | Isoform Strand | Overlap Bp | Query Overlap Per | Isoform Overlap Per | Noncoding | Promoter Per | Exonintron Per | End Per |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
36774 | TTC39A | 871 | uc001csk.3 | chr1 | 51752930 | 51787938 | - | 150 | 100.0 | 0.05 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
36774 | TTC39A | 871 | uc001csl.3 | chr1 | 51752930 | 51787938 | - | 150 | 100.0 | 0.09 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
36774 | TTC39A | 871 | uc001csn.3 | chr1 | 51761210 | 51796234 | - | 150 | 100.0 | 0.04 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0) | 0.0 |
36774 | TTC39A | 871 | uc001cso.1 | chr1 | 51762903 | 51796999 | - | 150 | 100.0 | 0.14 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0) | 0.0 |
36774 | TTC39A | 871 | uc009vyy.1 | chr1 | 51767244 | 51796617 | - | 150 | 100.0 | 0.14 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0) | 95.33 |
36774 | TTC39A | 871 | uc010ond.2 | chr1 | 51752930 | 51795845 | - | 150 | 100.0 | 0.19 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
36774 | TTC39A | 871 | uc010one.2 | chr1 | 51752930 | 51796234 | - | 150 | 100.0 | 0.14 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
36774 | TTC39A | 871 | uc010onf.2 | chr1 | 51752930 | 51810785 | - | 150 | 100.0 | 0.19 | 0 | 0.0 | E1 (0), I1 (0), E2 (0), I2 (0), E3 (0), I3 (0), E4 (0), I4 (0), E5 (0), I5 (0), E6 (0), I6 (0), E7 (0), I7 (0), E8 (0), I8 (0), E9 (0), I9 (4), E10 (45.33), I10 (51.33), E11 (0), I11 (0), E12 (0), I12 (0), E13 (0), I13 (0), E14 (0), I14 (0), E15 (0), I15 (0), E16 (0), I16 (0), E17 (0), I17 (0), E18 (0) | 0.0 |
Dmrid | Feature Chr | Feature Start | Feature End | Set | Name | Fields |
---|---|---|---|---|---|---|
36774 | chr1 | 51767966 | 51768115 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 3 | score:328, srow:39138 |
36774 | chr1 | 51768206 | 51768415 | wgEncodeRegDnaseClusteredV2 | 2 | score:256, srow:39139 |
36774 | chr1 | 51768190 | 51768202 | tfbsConsSites | V$AREB6_01 | score:884, zScore:1.75, srow:127850 |
36774 | chr1 | 51768232 | 51768244 | tfbsConsSites | V$IK1_01 | score:879, zScore:2.22, srow:127851 |
36774 | chr1 | 51768232 | 51768244 | tfbsConsSites | V$IK3_01 | score:931, zScore:3.26, srow:127852 |
36774 | chr1 | 51768171 | 51768171 | cosmic | COSM36808 | srow:32724 |
36774 | chr1 | 51768233 | 51768233 | cosmic | COSM1343281 | srow:32725 |
36774 | chr1 | 51768233 | 51768233 | cosmic | COSM1343282 | srow:32726 |
36774 | chr1 | 51768117 | 51768118 | phastConsElements100way | lod=14 | score:255, srow:227911 |
36774 | chr1 | 51768171 | 51768186 | phastConsElements100way | lod=130 | score:475, srow:227912 |
36774 | chr1 | 51768191 | 51768201 | phastConsElements100way | lod=105 | score:454, srow:227913 |
36774 | chr1 | 51768206 | 51768206 | phastConsElements100way | lod=16 | score:268, srow:227914 |
36774 | chr1 | 51768209 | 51768210 | phastConsElements100way | lod=38 | score:354, srow:227915 |
36774 | chr1 | 51768213 | 51768216 | phastConsElements100way | lod=43 | score:366, srow:227916 |
36774 | chr1 | 51768218 | 51768219 | phastConsElements100way | lod=35 | score:345, srow:227917 |
36774 | chr1 | 51768221 | 51768225 | phastConsElements100way | lod=36 | score:348, srow:227918 |
36774 | chr1 | 51768227 | 51768234 | phastConsElements100way | lod=53 | score:387, srow:227919 |
36774 | chr1 | 51768236 | 51768237 | phastConsElements100way | lod=22 | score:300, srow:227920 |
36774 | chr1 | 51768239 | 51768240 | phastConsElements100way | lod=28 | score:323, srow:227921 |
36774 | chr1 | 51768242 | 51768243 | phastConsElements100way | lod=32 | score:337, srow:227922 |
36774 | chr1 | 51768245 | 51768247 | phastConsElements100way | lod=44 | score:368, srow:227923 |
Dmrid | Omic Set | Data | Plot |
---|---|---|---|
36774 | cellmeth_recounts | PrEC: 3, LNCaP: 0, DU145: 0 | |
36774 | cellexp | id=ENSG00000085831, name=TTC39A, PrEC=67, str=178, LNCaP=1099, str=1415, DU145=462, str=464 | |
36774 | tcgaexp | gene=TTC39A, entrez=22996, pos=chr1:51752930-51810785(-), B=3376, L=4673, M=4194, H=3516 | |
36774 | tcgaexp | gene=LOC100133331, entrez=100133331, pos=chr1:322037-180753553(-), B=268, L=328, M=271, H=305 | |
36774 | pubmed | gene=TTC39A, G=1, GP=0, GC=1, GM=0, GPM=0, GCM=0 |